За свою недолгую жизнь Геннадию Семеновичу удалось познать счастье и горести социологического ремесла. Его богатая на академические достижения биография — яркий пример самозабвенного служения науке, которая стала для Батыгина и призванием, и профессией.
Геннадий Семенович оставил после себя богатое интеллектуальное наследие в самом широком смысле слова — не только многочисленные научные труды, но и целое поколение социологов, умеющих критически мыслить и понимать сложные социальные процессы. Батыгин всегда оставался верным выбранному пути и ждал того же от своих подопечных. «Если тот или иной из его учеников на каком-то этапе своей начинающейся профессиональной биографии, проявляя слабость или повинуясь обстоятельствам, "откалывался от науки" (например, "уходил в бизнес"), он говорил: "умер человек"», — вспоминает его бывший аспирант Денис Глебович Подвойский.
Среди основных научных трудов ученого:
• Социальные показатели образа жизни советского общества: методологические проблемы. М.: Наука, 1980. (Соавт. И.В. Бестужев-Лада, Т.М. Дридзе и др.).
• Обоснование научного вывода в прикладной социологии. М.: Наука, 1986.
• Лекции по методологии социологических исследований. Учебник для высших учебных заведений. М.: Аспект-пресс, 1995. М.: Изд-во РУДН, 2007.
• Социальные науки в постсоветской России. М.: Академический проект, 2005.
• История социологии: (учебник) / Г.С. Батыгин, Д.Г. Подвойский; Федеральное агенство по образованию; Национальный фонд подготовки кадров. М.: Издательский дом "Высшее образование и наука", 2007.