Широкую известность Хантингтону принесла представленная в одноименной книге концепция «столкновения цивилизаций», согласно которой основным источником международных конфликтов в поствоенное время станут не экономические и идеологические, а культурные и религиозные различия. Автор утверждал, что универсалистские притязания Запада столкнутся с сопротивлением других цивилизаций, стремящихся сохранить свою самобытность. Несмотря на критику и обвинения в культурном детерминизме, Хантингтон отчасти предвидел растущее влияние незападных цивилизаций и формирование многополярного мира.
В 1999-2001 гг. под руководством Хантингтона и Бергера было проведено масштабное сравнительное исследование глобализации культуры в десяти странах, изложенное на страницах книги «Многоликая глобализация. Культурное разнообразие в современном мире». Представляет ли глобализация угрозу национальной идентичности? Ищите ответ в рецензии В.В.Фёдорова.
В числе других работ автора:
• Столкновение цивилизаций. М., 2003. (Рецензия В.В.Фёдорова).
• Кто мы? Вызовы американской национальной идентичности. АСТ, 2018. (Рецензия В.В.Фёдорова)
• Культура имеет значение. Московская школа политических исследований, 2002.
• Вызовы и ответы. Как гибнут цивилизации (в соавт. с А.Тойнби). Алгоритм, 2016.